Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MTA3Q9BTC8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MTA3Q9BTC8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms