Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C2orf88Q9BSF0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C2orf88Q9BSF0 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms