Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KCNS3Q9BQ31 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
KCNS3Q9BQ31 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms