Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPOCK3Q9BQ16 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms