Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SENP8Q96LD8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SENP8Q96LD8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms