Protein–RNA interactions for Protein: Q96B67

ARRDC3, Arrestin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3Q96B67 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ARRDC3Q96B67 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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