Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RNF34Q969K3 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms