Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHMTQ93088 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms