Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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HDDC3Q8N4P3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HDDC3Q8N4P3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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