Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
P3H3Q8IVL6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
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