Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APTXQ7Z2E3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APTXQ7Z2E3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms