Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ANKRD54Q6NXT1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms