Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATL3Q6DD88 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms