Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FAM46CQ5VWP2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms