Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PHYHD1Q5SRE7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms