Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC39A12Q504Y0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms