Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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HIF1AQ16665 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIF1AQ16665 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIF1AQ16665 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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