Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TAF1AQ15573 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms