Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CDSNQ15517 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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CDSNQ15517 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CDSNQ15517 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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