Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FHL3Q13643 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms