Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SGCGQ13326 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGCGQ13326 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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