Protein–RNA interactions for Protein: Q13183

SLC13A2, Solute carrier family 13 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A2Q13183 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SLC13A2Q13183 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SLC13A2Q13183 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms