Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CHAF1BQ13112 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CHAF1BQ13112 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CHAF1BQ13112 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHAF1BQ13112 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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