Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TROQ12816 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TROQ12816 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TROQ12816 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TROQ12816 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TROQ12816 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms