Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PSME1Q06323 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms