Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNC1Q01954 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms