Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MDM2Q00987 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms