Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P62684 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P62684 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms