Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB28P51157 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB28P51157 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RAB28P51157 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RAB28P51157 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms