Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASP4P49662 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms