Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTPAP49638 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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