Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GCLMP48507 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCLMP48507 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCLMP48507 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCLMP48507 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GCLMP48507 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GCLMP48507 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms