Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CHRNA7P36544 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.3 ms