Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP5C1P36542 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms