Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXD13P35453 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms