Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PTGS2P35354 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms