Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXA6P31267 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms