Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NFKBIAP25963 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms