Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
USF1P22415 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
USF1P22415 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
USF1P22415 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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