Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AP002807.1-203ENST00000534517 664 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB3P14651 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms