Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KRT3P12035 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRT3P12035 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms