Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP2C9P11712 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms