Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00032P0C843 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms