Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLA1P09884 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLA1P09884 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLA1P09884 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLA1P09884 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLA1P09884 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLA1P09884 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLA1P09884 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLA1P09884 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLA1P09884 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLA1P09884 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms