Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCDC169A6NNP5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms