Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PSDA5PKW4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms