Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLXND1Q9Y4D7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms