Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX7Q9UNH6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX7Q9UNH6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms