Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP91

SLC6A20, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A20Q9NP91 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SLC6A20Q9NP91 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms