Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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LIN28AQ9H9Z2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIN28AQ9H9Z2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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LIN28AQ9H9Z2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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